В фильме юный Индиана Джонс демонстрирует свой шрам от кнута. Однако рубец на подбородке уже у взрослого Джонса имеет реальное происхождение. Когда Харрисону Форду было 20 лет, он повредил подбородок в автомобильной аварии.

Незадолго до начала съёмок фильма у актёра Денхолма Эллиотта, сыгравшего Мариуса Броди, диагностировали СПИД. Он был серьёзно болен в течение многих дней.

На самом деле в этой сцене Харрисон Форд и Шон Коннери сидят без штанов, так как на съёмочной площадке было невероятно жарко, а Коннери не хотел вспотеть.

Когда Джордж Лукас вёл переговоры со Стивеном Спилбергом по поводу съёмок третьего фильма о приключениях Индианы Джонса, то предложил ему сделать картину в духе «особняка с привидениями». Однако Спилберг, недавно спродюсировавший фильм «Полтергейст», отклонил его задумку, так как хотел снять что-нибудь отличное от предыдущей картины. Тогда Лукас придумал идею со Святым Граалем, а Спилберг ввёл в действие историю с пропавшим отцом Индианы Джонса.

В оригинальном сценарии была включена сцена погони на мотоцикле через Великую Китайскую стену. Однако правительство Китая не дало на неё своего разрешения, поэтому она была заменена сценой с авиакатастрофой.

Актёр Д. Р. Нанаяккара, исполнивший роль шамана деревни, совершенно не умел говорить по-английски. Свой текст он произносил, подражая речи Стивена Спилберга. Актёр делал паузы в диалогах не ради драматического эффекта: он ждал, когда режиссёр произнесёт следующую фразу.

В сцене разрушения моста с него упали 14 манекенов. Руки и ноги кукол приводились в движение вставленными в них батарейками, чтобы создалось впечатление натуральных размахиваний.

Ради участия в съёмках фильма актриса Кейт Кэпшоу брала уроки, чтобы научиться кричать.

Специалистам по кастингу пришлось обойти множество школ в поисках мальчика с азиатской внешностью, который должен был сыграть роль Коротышки. Джонатан Ке Кван тогда привёл на кастинг своего младшего брата. Сам он не планировал пробоваться на роль, а только оказывал брату моральную поддержку. Именно Ке Кван привлёк внимание помощника режиссёра, так как во время проб он постоянно подсказывал брату, что нужно делать, а чего – не стоит.

Ради роли Мола Рама в «Храме судьбы» актёр Амриш Пури побрился наголо. Его герой так понравился индийским зрителям, что с тех пор актёр был вынужден брить голову до конца своих дней и тем самым поддерживать образ одного из самых популярных индийских кино-злодеев.

Все трое главных персонажей фильма «Индиана Джонс и храм судьбы» получили свои имена в честь собак своих создателей. Коротышкой звали собаку сценариста Уилларда Хайка, имя Вилли являлось кличкой кокер-спаниеля Стивена Спилберга, а Индиану назвали в честь аляскинского маламута Джорджа Лукаса.