Полное имя - Бенджамин Гиза Аффлек-Болдт (Benjamin Geza Affleck-Boldt).
Мать, Кристин Энн Болдт - школьная учительница. Отец - Тимоти Байерс Аффлек, перепробовал множество профессий, успев поработать сантехником, социальным работником, автомехаником, барменом, фармацевтом, а также режиссёром и актёром в Театральной компании Бостона. Впоследствии Бен использовал опыт работы отца в создании образа Уилла Хантинга.
У Бена есть младший брат, тоже известный актёр - Кейси Аффлек.
В 1984 году их родители разводятся и братья переезжают вместе с матерью в Массачусетс.
В возрасте восьми лет Бен знакомится со своим соседом и дальним родственником старше его на два года - Мэттом Дэймоном. Будущие звёзды Голливуда учились в одной школе, но в разных классах. После окончания школы Аффлек поступает в Вермонтский университет, но бросает учёбу после первого семестра.
Актёрская карьера Бена Аффлека начинается ещё в детстве, когда он становится ведущим научно-популярного детского сериала "Путешествие Мими" (The Voyage of the Mimi, 1984) на канале PBS.
В 1992 году Аффлек и Мэтт Дэймон играют в подростковом фильме "Школьные узы" (School Ties, 1992).
В 1993 году Бен получает роль в нашумевшей драме "Под кайфом и в смятении" (Dazed and Confused), а комедия "Тусовщики из супермаркета" (Mallrats, 1995) приносит ему широкую известность. Закрепить успех помогает ещё один фильм режиссёра Кевина Смита - "В погоне за Эми" (Chasing Amy, 1997).
В 1997-м Аффлек вместе с Мэттом Дэймоном дебютируют в качестве сценаристов, написав сценарий для фильма "Умница Уилл Хантинг" (Good Will Hunting), где вместе с Робином Уильямсом играют главные роли. За сценарий к этой картине друзья получают "Золотой глобус" и "Оскар" в номинации "лучший оригинальный сценарий".
В 1998 году Бен Аффлек получает роль в блокбастере "Армагеддон" (Armageddon, 1998), собравшем в прокате около $600 млн.
В 1999-м он впервые играет главную мужскую роль в комедии "Силы природы" (Forces of Nature).
В 2001 году Аффлек играет одну из главных ролей в исторической драме "Перл-Харбор" (Pearl Harbor), сборы от кинопроката которой составили около $450 млн.
В 2002 году Бен Аффлек снимается в двух фильмах с корифеями Голливуда: "Чужой ряд" (Changing Lanes) с Сэмуэлем Л. Джексоном и "Цена страха" (The Sum of All Fears) с Морганом Фрименом.
В следующем году Бен Аффлек игает своего любимого героя комиксов - "Сорвиголову" (Daredevil, 2003), который успешно проходит в прокате, собрав больше $179 млн.
В 2006-м, после почти двухлетнего перерыва, Бен Аффлек выпускает новый фильм - "Смерть супермена" (Hollywoodland , 2006): биографическую криминальную ленту о расследовании смерти Джона Ривза, звезды сериала о Супермене.
В 2007 году Бен Аффлек дебютирует в качестве режиссёра, сняв триллер "Прощай, детка, прощай" (Gone Baby Gone) о расследовании похищения маленькой девочки, по мотивам книги Дэнниса Лихейна. В главных ролях снимаются такие актёры, как Морган Фримен, Кейси Аффлек и Мишель Монахэн.
В 2009 году Бен возобновляет актёрскую карьеру после длительного перерыва, снявшись в романтической комедии "Обещать – не значит жениться" (He's Just Not That Into You, 2009), политическом триллере "Большая игра" (State of Play, 2009) - вместе с Расселом Кроу и Хелен Миррен, и комедии "Экстракт" (Extract, 2009).
В 2010-м на экраны выходит вторая работа Бена Аффлека в качестве режиссёра - "Город воров" (The Town). Также он играет в фильме одну из главных ролей, вместе с Джереми Реннером, Джоном Хэммом и Крисом Купером.
В 2005 году Бен женился на актрисе Дженнифер Гарнер - его коллеге по фильму "Сорвиголова". У пары трое детей: дочери - Вайолет Энн (родилась в декабре 2005) и Серафина Роуз Элизабет (родилась в январе 2009 года), и сын - Сэмюэль Гарнер Аффлек (родился в феврале 2012).